離子交換色譜常用的固定相為離子交換樹脂。目前常用的離子交換樹脂分為三種形式，一是常見的純離子交換樹脂。第二種是玻璃珠等硬芯子表面涂一層樹脂薄層構(gòu)成的表面層離子交換樹脂，第三種為大孔徑網(wǎng)絡(luò)型樹脂。它們各有特點(diǎn)，例如第二種樹脂有很高的柱效，但它的柱容量不大；第三種樹脂適用于非水溶液中物質(zhì)的分離，因?yàn)樗鼈兊目讖胶蛢?nèi)表面積大，不需要用水溶脹，便可滿意地使用。
典型的離子交換樹脂是由苯乙烯和二乙烯基苯交聯(lián)共聚而成：
其中，二乙烯基苯起了交聯(lián)和加牢整個(gè)構(gòu)型的作用，其含量決定了樹脂交聯(lián)度大小。交聯(lián)度一般控制在4%～16%范圍內(nèi)，高度交聯(lián)的樹脂較硬而且脆，也較滲透，但選擇性較好。在基體網(wǎng)狀結(jié)構(gòu)上引入各種不同酸堿基團(tuán)作為可交換的離于基團(tuán)。
按結(jié)合的基團(tuán)不同，離子交換樹脂可分為陽離子交換樹脂和陰離子交換樹脂。陽離子交換樹脂上具有與樣品中陽離子交換的基團(tuán)。陽離子交換樹脂又可分為強(qiáng)酸性和弱酸性樹脂。強(qiáng)酸性陽離子交換樹脂所帶的基團(tuán)為磷酸基（一），其中和有機(jī)聚合物牢固結(jié)合形成固定部分，是可流動(dòng)的能為其他陽離子所交換的離子。
陰離子交換樹脂具有與樣品中陰離子交換的基團(tuán)。陰離子交換樹脂也可分為強(qiáng)堿性和弱堿性樹脂。
陰離子交換樹脂屬強(qiáng)堿性，它是由有機(jī)聚合物骨架和一季胺堿基團(tuán)所組成，它帶有正電荷。而與相反的是可以移動(dòng)的部分，它能被其它陰離子所交換。

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